Podczas każdej replikacji liniowego DNA telomery ulegają skróceniu. Dlaczego? Bo polimeraza DNA - enzym przeprowadzający replikację - potrafi wydłużać łańcuchy polinukleotydowe tylko w kierunku 5'-3' nowo syntetyzowanej nici, a w dodatku, aby zacząć jej syntezę, potrzebuje jako startera krótkiego, komplementarnego do kopiowanej nici fragmentu RNA (dostarcza 3'-końcowej grupy -OH). Po zakończeniu wydłużania startera zostaje on enzymatycznie usunięty z nowo zsyntetyzo-wanej nici, a powstałą lukę wypełnia, wyspecjalizowana w tego typu reakcjach, polimeraza DNA zależna od DNA. Starter znajduje się również na 5' końcu nici opóźnionej (replikacja liniowego DNA), więc gdy zostanie usunięty, pojawia się problem, ponieważ polimeraza, nie dysponując wolnym 3' końcem nici DNA, nie potrafi zsyn-tetyzować sekwencji komplementarnej do jednoniciowego obszaru powstałego po usunięciu wyżej wspomnianego startera. To zjawisko jest znane jako problem replikacji końców liniowych DNA.